部份研究指出，新冠疫苗的保护效力会随时间下降，许多国家已经开始让民众追打第3剂疫苗。究竟新冠疫苗的保护效力为何不能够再持久一些？甚至达到终身免疫，让民众只打一剂就能一劳永逸？《华尔街日报》（Wall Street Journal）指出，主要有疫苗并非使用复制型病毒、新冠病毒会不断变异、以及新冠病毒会感染上呼吸道等3大原因。
《华尔街日报》报道，施打麻疹疫苗可以终身免疫，水痘疫苗的保护力可以维持10至20年，破伤风疫苗可以至少持续10年，为何新冠疫苗的保护力不能维持更久？
报道指出，效果最好的疫苗通常都是使用复制型病毒（replicating viruses），这种疫苗能够诱发终身免疫力，例如麻疹疫苗及水痘疫苗，都是使用复制型病毒。
非复制型疫苗、或者蛋白质疫苗（又称重组蛋白疫苗），例如破伤风疫苗，诱发的免疫力就没有这么久，但透过加入佐剂，可以加强疫苗的保护效力。佐剂可以放大疫苗的反应。破伤风疫苗及A型肝炎疫苗就有添加佐剂。
相较之下，AZ疫苗、强生疫苗使用的是非复制型的腺病毒，当中也未添加佐剂；辉瑞/BNT及莫德纳疫苗采用mRNA技术，其中甚至未涵盖任何病毒。
新冠疫苗效力较不持久的第2个原因是，新冠病毒会变异。麻疹、腮腺炎、水痘等病毒几乎不会变异，但是新冠病毒至今至少已经发展出8种变异株。
美国俄勒冈健康与科学大学（Oregon Health & Science University）教授斯利夫卡（Mark Slifka）指出，病毒会变异确实让疫苗的作用变得更复杂，他说流感病毒也会变异，因此每年都要调整、制造新的流感疫苗，尽可能和新的流感病毒株相符。流感疫苗提供的保护力能维持6个月。
第3个关键是，新冠病毒会同时在上呼吸道及下呼吸道复制病毒。斯利夫卡指出，肺脏及身体有良好的循环，但是鼻孔表面没有，因此我们接种疫苗可以避免重症，因为下呼吸道有抗体，但同时间上呼吸道仍有少量病毒，而且上呼吸道的感染将持续。
根据伦敦帝国学院（Imperial College London）的研究人员，次世代疫苗除了将专注于对抗新冠变异株，也可能针对加强鼻子免疫力进行改良。
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